Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx3P81067 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx3P81067 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms