Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.4 ms