Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf3P61205 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf3P61205 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf3P61205 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Arf3P61205 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms