Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms