Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P58686 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P58686 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P58686 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P58686 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P58686 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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