Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FmodP50608 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FmodP50608 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms