Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms