Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms