Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms