Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms