Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms