Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms