Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms