Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms