Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms