Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms