Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms