Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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