Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18529 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18529 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18529 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18529 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18529 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18529 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18529 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18529 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18529 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18529 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18529 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18529 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18529 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18529 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18529 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P18529 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P18529 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P18529 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P18529 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P18529 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P18529 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms