Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hoxa5P09021 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hoxa5P09021 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxa5P09021 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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