Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna4P07351 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna4P07351 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms