Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sp100O35892 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms