Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.3 ms