Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Prrt1O35449 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Prrt1O35449 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Prrt1O35449 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Prrt1O35449 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Prrt1O35449 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Prrt1O35449 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms