Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms