Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap23O09044 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap23O09044 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap23O09044 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap23O09044 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap23O09044 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap23O09044 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap23O09044 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap23O09044 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snap23O09044 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snap23O09044 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snap23O09044 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snap23O09044 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snap23O09044 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snap23O09044 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snap23O09044 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap23O09044 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms