Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer2J3QPU5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms