Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Smim18J3QNP2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Smim18J3QNP2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Smim18J3QNP2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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