Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm20918J3QN17 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm20918J3QN17 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm20918J3QN17 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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