Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms