Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms