Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms