Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms