Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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