Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms