Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms