Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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