Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms