Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms