Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms