Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sh3bgrQ9WUZ7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sh3bgrQ9WUZ7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sh3bgrQ9WUZ7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sh3bgrQ9WUZ7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sh3bgrQ9WUZ7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sh3bgrQ9WUZ7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms