Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms