Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc42ep4Q9JM96 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms