Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLZ8

Sigirr, Single Ig IL-1-related receptor, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SigirrQ9JLZ8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SigirrQ9JLZ8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SigirrQ9JLZ8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms