Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms