Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trim39Q9ESN2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trim39Q9ESN2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trim39Q9ESN2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trim39Q9ESN2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trim39Q9ESN2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trim39Q9ESN2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trim39Q9ESN2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trim39Q9ESN2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trim39Q9ESN2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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