Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms