Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn4aQ9ER60 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms