Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Tspan4Q9DCK3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Tspan4Q9DCK3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Tspan4Q9DCK3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Tspan4Q9DCK3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tspan4Q9DCK3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tspan4Q9DCK3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tspan4Q9DCK3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tspan4Q9DCK3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tspan4Q9DCK3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tspan4Q9DCK3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Tspan4Q9DCK3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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