Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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